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簡介
作為噬菌體衍生的酶，內(nèi)溶素本質(zhì)是一種蛋白分子，其通過分解細菌細胞壁的肽聚糖成分，幫助噬菌體顆粒從細菌宿主釋放，可在噬菌體復制過程中表達，破壞細菌細胞壁肽聚糖的關鍵化學鍵。
原理
通過內(nèi)溶素的蛋白表達、純化能夠?qū)?nèi)溶素基因克隆到表達載體（如 pET28a），進一步轉化大腸桿菌進行擴增，重組質(zhì)粒經(jīng) IPTG 誘導表達，得到經(jīng)鎳柱純化的內(nèi)溶素蛋白。
用途
為治療抗生素耐藥的細菌感染提供潛在解決方案。
材料與儀器
儀器：
離心機、超聲破碎儀
恒溫搖床、恒溫培養(yǎng)箱、PCR 儀、電泳儀
凝膠掃描儀、鎳柱純化系統(tǒng)、0.22 μm 濾膜
試劑：
質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒
核酸內(nèi)切酶、T4 連接酶、Pfu 聚合酶
IPTG、考馬斯亮藍
步驟
1、引物設計：對待研究的內(nèi)溶素完成基因組測序注釋工作，根據(jù)已測基因組進行引物設計 P1 與 P2，并引入酶切位點。
2、PCR 擴增內(nèi)溶素基因：反應體系與程序見表 1。
3、PCR 反應條件：95 ℃ 預變性 5 min，95 ℃ 變性 30 s，Tm 溫度下退火30 s，72 ℃ 延伸 30 s，共 30 個循環(huán)，72 ℃ 最后延伸 10 min，26 ℃ 再反應 2 min（終止反應）。
4、回收 PCR 產(chǎn)物膠：進行瓊脂糖凝膠電泳，將 50 μL 全部上樣，切下目的基因條帶，使用膠回收試劑盒回收目的基因（一般實驗室都會有常用品牌）。
5、抽提質(zhì)粒：使用質(zhì)粒抽提試劑盒抽提載體質(zhì)粒（一般實驗室都會有常用品牌）。
6、對位點進行酶切：利用一開始設計好的酶切位點對載體與目的基因進行雙酶切，在 37 ℃ 下反應 3 h。
7、切膠回收：將酶切產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳，切取含 DNA 片段的目的條帶并進行回收，得到 DNA 后檢測其濃度并保存在 -20 ℃ 冰箱備用。
8、DNA 與載體連接：用 T4 連接酶連接載體與 DNA 片段，在 16 ℃ 下過夜。
9、轉化大腸桿菌：取 50 μL 大腸桿菌 BL21 感受態(tài)細胞，加入 5 μL 連接液后冰上孵育 30 min，搖勻后 42 ℃ 水浴熱休克 90 s，然后迅速冰浴 2 min，冰浴后再加入已經(jīng)預熱的 1 mL LB 培養(yǎng)基，37 ℃ 搖床震蕩 1 h 復蘇，最后涂板至卡那霉素抗性的平板，37 ℃ 溫度下培養(yǎng)過夜。次日挑取單菌落進行菌落 PCR，將陽性菌落接種于培養(yǎng)基中 37 ℃ 溫度下培養(yǎng)過夜。
10、抽提質(zhì)粒并進行雙酶切驗證（參見 5、6 步）。
1、少量誘導表達：挑選單菌落過夜培養(yǎng)，過夜菌接種至 1 mL 培養(yǎng)基，37 ℃ 培養(yǎng) 2~3 h，再加入 10 μL 0.1 M 的 IPTG 在 16 ℃ 誘導 4 h，取 20 μL 菌液加入 7.5 μL 的蛋白緩沖上樣液，100 ℃ 沸水煮 10 min 后電泳，倒入考馬斯亮藍過夜震蕩，清洗后尋找發(fā)現(xiàn)目標蛋白條帶存在，進一步擴大培養(yǎng)。
2、擴大培養(yǎng)：將陽性菌落涂布平板過夜，挑選單菌落接種至 10 mL 培養(yǎng)基，37 ℃ 培養(yǎng) 6 h，按 1:100 比例接種于 500 mL 培養(yǎng)液中，37 ℃ 搖床至 OD600 值為 0.6~0.8，加入終濃度為 1 mM 的 IPTG 誘導劑，在 16 ℃ 下繼續(xù)培養(yǎng) 12 h。
3、細胞破碎：菌液離心 10 min（4000 g，4 ℃），重懸于 30 mL PBS，加入 PMSF 和 tritonX-100 冰浴 1 h 后超聲破碎，破碎菌液在 4 ℃ 轉入 50 mL 離心管，12000 rpm 離心10 min，取上清液用 0.22 μm 濾膜過濾雜質(zhì)。
4、蛋白純化：采用 Ni-NTA 純化系統(tǒng)進行鎳柱親和層析純化目的蛋白，純化后跑電泳，分析蛋白純度。
注意事項
1. PCR 條件與程序需要根據(jù)實驗進行梯度摸索。
2. T4 連接酶在高溫不穩(wěn)定，通常 16 ℃ 連接過夜，在 25 ℃ 左右的室溫能維持七八個小時。
常見問題
蛋白誘導表達效果不好（蛋白誘導表達條件并不一定適用所有實驗室，需要自己做實驗摸索條件）。
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